136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3099 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  830    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 1075 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  29.29 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  28.84 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.21 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.76 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.12 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.97 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  34.18 
 
 		 189 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  25.83 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.33 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  24.31 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  23.73 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.35 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.59 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.15 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 426 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.59 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.33 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  24.28 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.59 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  23.77 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.43 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  23.77 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  24.28 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.43 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  24.26 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 428 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23.59 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  28.46 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  23.32 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.29 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.34 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  22.56 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.64 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  21.64 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>