30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8042 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  842    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 410 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  37.94 
 
 		 419 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 443 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  25.48 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  30.42 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  29.73 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  27.09 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>