More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1802 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  97.26 
 
 		 401 aa  719    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  83.17 
 
 		 401 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  100 
 
 		 401 aa  793    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  83.17 
 
 		 401 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  83.17 
 
 		 401 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  80.3 
 
 		 401 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  81.12 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  81.12 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  81.12 
 
 		 402 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  81.12 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  81.12 
 
 		 402 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  81.12 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  80.15 
 
 		 402 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  81.12 
 
 		 402 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  81.12 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  79.15 
 
 		 402 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  79.15 
 
 		 402 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  79.15 
 
 		 402 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  79.15 
 
 		 402 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  79.15 
 
 		 402 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  81 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  78.39 
 
 		 402 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  82.66 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  73.6 
 
 		 411 aa  564  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  40 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  29.44 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  29.68 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  25.41 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.28 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.14 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.28 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.94 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.06 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.67 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.27 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  29.83 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.53 
 
 		 397 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  26.82 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.76 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.12 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 454 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 456 aa  86.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 454 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.95 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  24.5 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.98 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  24.5 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.98 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.97 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.97 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  24.21 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  24.21 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.78 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>