More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2918 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  765    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  30.08 
 
 
423 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  30.45 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  28.72 
 
 
412 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.53 
 
 
419 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.16 
 
 
424 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.1 
 
 
424 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.92 
 
 
423 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.69 
 
 
424 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
423 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  28.65 
 
 
407 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  30.36 
 
 
450 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.56 
 
 
416 aa  99.8  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  26.5 
 
 
404 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.43 
 
 
423 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.64 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.82 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  28.92 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
423 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  28.92 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  28.92 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  28.92 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  28.92 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  28.92 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  28.92 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  28.46 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.41 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  28.92 
 
 
397 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
445 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  28.92 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  30.3 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  28.72 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.5 
 
 
398 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  29.95 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
401 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.81 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  27.04 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  26.97 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  26.97 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  26.97 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.93 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  26.32 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.2 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.25 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.2 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  30.66 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  26.84 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  27 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  26.63 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  25.82 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  25.61 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  29.04 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  25.82 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.22 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  25.82 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  25.82 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  25.82 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  36.88 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  25.22 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  24.29 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  26.73 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  26.73 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  26.73 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  24.23 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.56 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.56 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  34.19 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.22 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.94 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.8 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>