36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6021 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  788    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  64.55 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  29.15 
 
 		 427 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 395 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  32.03 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  30.43 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  30.65 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  34.29 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 640 aa  44.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 488 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>