14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2901 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  300  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 418 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 417 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 433 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  36 
 
 		 395 aa  63.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  29.85 
 
 		 427 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 460 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 409 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 443 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  34.56 
 
 		 419 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 429 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>