34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0959 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  831    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  88.35 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  35.54 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 436 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  26.95 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  25.93 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  26.8 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  32.8 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.7 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  25.53 
 
 		 189 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  22.43 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.64 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.64 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.89 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.89 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.89 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.21 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.21 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>