55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3758 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 418 aa  804    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  40.3 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  26.17 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 443 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  31.28 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  28.37 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  33.56 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.17 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  29.74 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.84 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.15 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  29.87 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.75 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  24.7 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  22.06 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>