33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3662 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  794    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 417 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  27.09 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 409 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  26.98 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  25 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  26.19 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  30.08 
 
 		 158 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.19 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  22.73 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  23.28 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  23.28 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  23.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  22.89 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  23.14 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  27.56 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0142  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.697552  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  21.83 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>