109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1481 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  100 
 
 
441 aa  870    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  73.62 
 
 
437 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  76.64 
 
 
436 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  76.46 
 
 
437 aa  648    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  73.5 
 
 
454 aa  634  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  65.41 
 
 
438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  62.09 
 
 
438 aa  545  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  33.94 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  28.54 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  24.13 
 
 
642 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  25.32 
 
 
474 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.371537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  23.25 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  26.99 
 
 
458 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  33.33 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.38 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  31.19 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  31.07 
 
 
472 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  23.84 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  34.57 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  33.33 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  33.33 
 
 
456 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  33.33 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  38.89 
 
 
451 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  30.86 
 
 
387 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  25.78 
 
 
410 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  25.78 
 
 
445 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  30.23 
 
 
465 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  33.33 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  26.04 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  27.56 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  25.78 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.76 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  28.31 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  32.1 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  30.86 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  25.45 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  30.08 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  29.63 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  27.49 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  30.12 
 
 
464 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  29.03 
 
 
459 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  32.53 
 
 
424 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  33.33 
 
 
544 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  46.03 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  31.33 
 
 
464 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  27.12 
 
 
474 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  33.33 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  30.86 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  28.92 
 
 
433 aa  43.9  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  37.23 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  29.63 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  30.86 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 
485 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  30.12 
 
 
464 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  29.63 
 
 
395 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  29.63 
 
 
395 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  29.63 
 
 
395 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
393 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.93 
 
 
459 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  30.12 
 
 
464 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  29.63 
 
 
385 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  29.63 
 
 
385 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
421 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 
427 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  30.86 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
462 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  30.86 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  30.86 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  30.86 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  32.53 
 
 
464 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>