84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0418 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  64.55 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  27.71 
 
 		 427 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  26.77 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  31.09 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.16 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  34.55 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  36.5 
 
 		 158 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.68 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.17 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  22.85 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.64 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  22.85 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  22.51 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  21.64 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  20.9 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.22 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  27.91 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.76 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  22.26 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.29 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  22.53 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.37 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  21.92 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  24.57 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  21.6 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3986  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  24.18 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  24.18 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  20.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  25.66 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  26.47 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  33.82 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  21.2 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  21.2 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  27.41 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>