35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2674 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  841    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  30.98 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 418 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  28.92 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 409 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  30.46 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 395 aa  99.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  32.11 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  34.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  25.75 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  25.75 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  25.75 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  25.75 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.55 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  25.45 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>