29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1069 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  751    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  88.35 
 
 		 434 aa  621  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 460 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  34.08 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  27.37 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 433 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  26.3 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  27.35 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  27.6 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 397 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.77 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.21 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>