78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8436 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 429 aa  823    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  37.59 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 433 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 460 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  27.83 
 
 		 427 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  30.52 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  28.01 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  32.18 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.34 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  21.7 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.16 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.87 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.29 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  23.68 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.66 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.64 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  21.79 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.1 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  29.1 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  29.1 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.42 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.42 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.42 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.13 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.42 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.42 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.13 
 
 		 397 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.13 
 
 		 397 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  19.62 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  51.11 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23.91 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>