More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6459 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  86.65 
 
 		 424 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  90.91 
 
 		 422 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  86.65 
 
 		 424 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  85.04 
 
 		 424 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  86.41 
 
 		 424 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  99.52 
 
 		 421 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  81.46 
 
 		 428 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  66.92 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  67.17 
 
 		 409 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  59.55 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  59.06 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  58.44 
 
 		 435 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  58.21 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  57.66 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  57.55 
 
 		 440 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  58.31 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  57.43 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  57.43 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  57.82 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  54.34 
 
 		 418 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  55.95 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  57.18 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  57.18 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  52.58 
 
 		 422 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  57.18 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  57.18 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  55.21 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  57.8 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  55.47 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  55.47 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  51.26 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  45.39 
 
 		 912 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  45.52 
 
 		 895 aa  349  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  45.34 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  45.34 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 441 aa  312  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  40.79 
 
 		 905 aa  299  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  42.46 
 
 		 917 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  41.94 
 
 		 452 aa  278  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 424 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  37.12 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  36.09 
 
 		 431 aa  269  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  41.81 
 
 		 893 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  37.29 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  36.91 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  35.42 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  37.02 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 494 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  33.69 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.53 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  36.29 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.53 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  35.31 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.53 
 
 		 389 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.27 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.27 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.27 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.27 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.27 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  34.91 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  34.81 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  36.59 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  36.31 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  34.31 
 
 		 405 aa  163  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  34.21 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  34.54 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>