More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0207 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
506 aa  1023    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  58.37 
 
 
494 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  43.27 
 
 
893 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 
444 aa  227  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  31.39 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  41.58 
 
 
431 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  41.58 
 
 
431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
420 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  39.74 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  38 
 
 
452 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
443 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  37.38 
 
 
453 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  39.4 
 
 
439 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  38.73 
 
 
472 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 
417 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  38.19 
 
 
912 aa  206  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 
460 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  37.17 
 
 
895 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  38.54 
 
 
472 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  39.1 
 
 
460 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  37.71 
 
 
427 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  36.99 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  36.99 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  38.78 
 
 
905 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  38.33 
 
 
417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  36.99 
 
 
426 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  37.7 
 
 
917 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  38.44 
 
 
459 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  38.18 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  38.41 
 
 
428 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  37.33 
 
 
436 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
435 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  37.09 
 
 
435 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  39.54 
 
 
413 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  37.33 
 
 
409 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  37.33 
 
 
426 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  37.33 
 
 
426 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  37.16 
 
 
418 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  37.33 
 
 
426 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  37.33 
 
 
426 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  37 
 
 
420 aa  190  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  39.33 
 
 
409 aa  189  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  38.74 
 
 
426 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  36.52 
 
 
429 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 
422 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  37.97 
 
 
418 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  35.67 
 
 
425 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  36.63 
 
 
402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  37.46 
 
 
422 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 
438 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 
438 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 
428 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  37.87 
 
 
424 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  36.67 
 
 
421 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  36.67 
 
 
421 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  35.54 
 
 
431 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  35 
 
 
437 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  32.87 
 
 
424 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  36.67 
 
 
424 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  32.74 
 
 
424 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  36.33 
 
 
424 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  36.33 
 
 
424 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  36 
 
 
424 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  39.26 
 
 
411 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
403 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  28.53 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  28.53 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  28.53 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  28.53 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  28.53 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  28.53 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  28.53 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  28.53 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  28.21 
 
 
389 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  32.01 
 
 
389 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  32.01 
 
 
389 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
382 aa  133  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
406 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  33.1 
 
 
403 aa  130  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  32.89 
 
 
399 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  33.93 
 
 
394 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
398 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
397 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  28.16 
 
 
389 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  29.71 
 
 
387 aa  124  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  30.43 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
419 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  28.83 
 
 
439 aa  120  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  29.12 
 
 
403 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  29.41 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
395 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  27.76 
 
 
418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.87 
 
 
416 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  27.59 
 
 
401 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  29.6 
 
 
423 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  28.16 
 
 
414 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>