More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1630 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  92.89 
 
 		 413 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  827    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  76.39 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  69.21 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  62.77 
 
 		 912 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  63.73 
 
 		 895 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  65.41 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  65.59 
 
 		 453 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  61.22 
 
 		 905 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  58.29 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  59.66 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  61.7 
 
 		 917 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  59.81 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  61.03 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  62.2 
 
 		 459 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  55.98 
 
 		 452 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  54.81 
 
 		 893 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  48.28 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  48.28 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  46.8 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  47.91 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  47.77 
 
 		 422 aa  359  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  45.97 
 
 		 435 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  46.03 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  47.7 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  46.03 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  46.1 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  44.29 
 
 		 417 aa  346  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 440 aa  346  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  48.28 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  48.28 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  48.28 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  48.28 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  48.28 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  46.45 
 
 		 437 aa  329  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 418 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  42.72 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  36.97 
 
 		 424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  43.14 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  43.14 
 
 		 424 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  42.89 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  33.65 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 472 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 494 aa  196  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  30.5 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  30.58 
 
 		 389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  30.5 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  30.5 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  30.5 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  30.5 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  30.5 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  33.25 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  30.25 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 394 aa  186  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 389 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 389 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 404 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  32 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  32.03 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 423 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.96 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  30.5 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  30.51 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  30.75 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  31.81 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  31.03 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 418 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>