More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1204 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  733    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  58.06 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  40.58 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  40.58 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  40.85 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  40.58 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  40.58 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  40.58 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  40.58 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  40.58 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  37.73 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  48.63 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  36.47 
 
 		 912 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  35.47 
 
 		 895 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  42.97 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  36.83 
 
 		 905 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  39.79 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  38.58 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  38.99 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  38.36 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.36 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  37.82 
 
 		 426 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  41.44 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  37.73 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  39.32 
 
 		 893 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  35.31 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  40.11 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  37.02 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.36 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  38.36 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.36 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.36 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.36 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  35.05 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  36.06 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  37.01 
 
 		 917 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 422 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  33.85 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 417 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  37.21 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  34.99 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  33.81 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  33.81 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  36.57 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 424 aa  189  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  30.64 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  36.83 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 425 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  33.59 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  30.15 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 416 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  36.29 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  37.14 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  36.69 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>