More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1980 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  100 
 
 
387 aa  752    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  80.89 
 
 
389 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  80.89 
 
 
389 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  52.76 
 
 
389 aa  411  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  53.54 
 
 
389 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  53.02 
 
 
389 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  53.02 
 
 
389 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  53.02 
 
 
389 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  52.76 
 
 
389 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  53.02 
 
 
389 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  53.28 
 
 
389 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  53.28 
 
 
389 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  52.76 
 
 
389 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 
382 aa  359  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
395 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  37.93 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.19 
 
 
441 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  33.24 
 
 
406 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
398 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.46 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  32.45 
 
 
411 aa  166  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
417 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  31.25 
 
 
401 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.83 
 
 
912 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  31.88 
 
 
407 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
420 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  30.71 
 
 
403 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  33.51 
 
 
405 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  31.98 
 
 
417 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
403 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.75 
 
 
895 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  28.49 
 
 
403 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  31.86 
 
 
399 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  25.9 
 
 
424 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  30.7 
 
 
406 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  30.7 
 
 
406 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  27.76 
 
 
403 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.91 
 
 
436 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  30.68 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  28.08 
 
 
435 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  31.1 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  28.97 
 
 
395 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  28.47 
 
 
426 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.47 
 
 
426 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
397 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
398 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
404 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  28.47 
 
 
426 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  25.18 
 
 
424 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
397 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  27.52 
 
 
420 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.69 
 
 
403 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  27.95 
 
 
905 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
435 aa  150  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  27.52 
 
 
426 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.7 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.95 
 
 
404 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  27.62 
 
 
418 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.19 
 
 
417 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  29.58 
 
 
390 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.34 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.12 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  30.15 
 
 
917 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  33.51 
 
 
398 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  28.53 
 
 
440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 
428 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  30.55 
 
 
414 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 
452 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  28.61 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  26.23 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  29.47 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.23 
 
 
431 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  28.01 
 
 
422 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  26.88 
 
 
403 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  29.78 
 
 
472 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.51 
 
 
426 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.51 
 
 
426 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  30.27 
 
 
893 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.51 
 
 
426 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.51 
 
 
426 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  25.06 
 
 
431 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
406 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  28.99 
 
 
403 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.46 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  28.89 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  27.86 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  30.71 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  27.42 
 
 
411 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  27.85 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  28.22 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  26.24 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
460 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
412 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>