More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  82.38 
 
 		 403 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  100 
 
 		 403 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  82.88 
 
 		 403 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  86.35 
 
 		 403 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  84.86 
 
 		 403 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  86.85 
 
 		 403 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  80.89 
 
 		 403 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  81.14 
 
 		 403 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  81.39 
 
 		 411 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  81.39 
 
 		 403 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  80.89 
 
 		 403 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  69.23 
 
 		 403 aa  559  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  66.17 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  66.17 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  64.52 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  61.52 
 
 		 411 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  62.53 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  61.21 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  64.03 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  57.4 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  50.47 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 412 aa  352  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 400 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  42.35 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 418 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  41 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 418 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 419 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 419 aa  258  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  38.97 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  34.25 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  34.25 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  34.25 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  34.25 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  35.31 
 
 		 606 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  34.85 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 397 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  34.85 
 
 		 468 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  36.91 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  32.88 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 455 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  32.16 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  32.43 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  36.36 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  31.01 
 
 		 895 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  36.93 
 
 		 390 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  32.51 
 
 		 912 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  31.64 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.54 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  31.32 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  31.45 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.45 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  31.25 
 
 		 917 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  32.7 
 
 		 905 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  30.59 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 441 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  31.98 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 444 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.05 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.05 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.05 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  33.15 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.05 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.05 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.05 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.33 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.05 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  34.77 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  35.06 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 382 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  34.07 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>