More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3771 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  779    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  69.06 
 
 		 404 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  71.32 
 
 		 403 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  69.8 
 
 		 404 aa  551  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  71.57 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  66.25 
 
 		 403 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  66.75 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  65.01 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  69.17 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  67.01 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  65.26 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  64.76 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  66.75 
 
 		 411 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  66.75 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  64.36 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  64.52 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  62.5 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  65.76 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  64.02 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  63.77 
 
 		 403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  53.98 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  55.78 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  43 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 418 aa  282  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 421 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 421 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  35.42 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  35.71 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  35.71 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  35.71 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  35.71 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  36.32 
 
 		 606 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  32.5 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.56 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  30.43 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  33.33 
 
 		 905 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 406 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  34.59 
 
 		 406 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  31.98 
 
 		 895 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  32.92 
 
 		 912 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 435 aa  166  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.18 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  32.8 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  32.8 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  30.58 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  30.58 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  30.3 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  34.66 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  30.58 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  30.58 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  30.58 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  30.58 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  30.58 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  33.73 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.87 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.09 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  29.68 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  33.6 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>