More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4430 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
398 aa  764    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  74.05 
 
 
403 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  73.14 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  61.14 
 
 
397 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  60.88 
 
 
398 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  57.03 
 
 
406 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  57.03 
 
 
406 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  56.77 
 
 
406 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 
406 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  56.95 
 
 
390 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  55.13 
 
 
418 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  56.17 
 
 
395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  54.67 
 
 
407 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  54.16 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  49.17 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  49.48 
 
 
414 aa  293  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
397 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 
412 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  46.25 
 
 
398 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2807  major facilitator superfamily MFS_1  54.19 
 
 
418 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.297836  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  45.75 
 
 
394 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 
395 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  33.42 
 
 
389 aa  212  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  33.16 
 
 
389 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  33.42 
 
 
389 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  32.37 
 
 
389 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  33.07 
 
 
389 aa  192  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  33.07 
 
 
389 aa  192  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  35.18 
 
 
404 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  35.25 
 
 
905 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  31.73 
 
 
387 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  32.83 
 
 
426 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  32.83 
 
 
426 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  35.79 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  35.01 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  33.33 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  34.41 
 
 
912 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  34.34 
 
 
404 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  35.17 
 
 
895 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  35.62 
 
 
423 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
420 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  31.16 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  35.16 
 
 
402 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  33.76 
 
 
441 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  33.15 
 
 
403 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  32.87 
 
 
403 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  33.98 
 
 
403 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  33.08 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.08 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.08 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.08 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.08 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  35.19 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
417 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  36.39 
 
 
426 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.5 
 
 
425 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  31.19 
 
 
428 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.9 
 
 
435 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  35.54 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  35.38 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  30.56 
 
 
418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  35 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  34.35 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  34.35 
 
 
411 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  29.78 
 
 
440 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  31.51 
 
 
437 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.88 
 
 
420 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
400 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
417 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  34.53 
 
 
403 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.22 
 
 
422 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  34.82 
 
 
403 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  35.26 
 
 
403 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
382 aa  156  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  31.62 
 
 
418 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  35.06 
 
 
422 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  34.11 
 
 
453 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  34.26 
 
 
403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  33.59 
 
 
429 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  33.53 
 
 
472 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  33.7 
 
 
417 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  37.55 
 
 
421 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  37.55 
 
 
421 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  31.63 
 
 
409 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  32.41 
 
 
418 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 
443 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  31.88 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  31.74 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  35 
 
 
917 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>