More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3763 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  79.46 
 
 		 418 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  84.8 
 
 		 436 aa  700    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  87.74 
 
 		 420 aa  746    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  87.02 
 
 		 435 aa  738    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  87.38 
 
 		 435 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 417 aa  835    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  85.57 
 
 		 440 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  85.23 
 
 		 428 aa  718    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  71.39 
 
 		 420 aa  591  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  68.05 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  66 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  66 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  64.43 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  67.84 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  66 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  62.5 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  62.5 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  67.01 
 
 		 409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  64.56 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  66 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  60.7 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  59.45 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 421 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  58.56 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  58.31 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  58.31 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  58.06 
 
 		 424 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  58.06 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  56.62 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  50.85 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  50.85 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  47.68 
 
 		 912 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  48.4 
 
 		 895 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  49.04 
 
 		 443 aa  358  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  48 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  44.83 
 
 		 905 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  47.2 
 
 		 917 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 460 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 460 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  44.17 
 
 		 452 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  47.49 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  36.69 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  38.44 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  43.41 
 
 		 893 aa  289  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 424 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 444 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 494 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  33.33 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  30.48 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.57 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  30.23 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  30.23 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  30.23 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  30.23 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  30.23 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  30.23 
 
 		 389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  30.23 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  31.81 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  31.16 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  31.16 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  31.89 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  32.35 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  29.41 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  30.85 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 398 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  30.85 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  32.1 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  31.89 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  31 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  31.71 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  31.98 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>