More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2675 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  776    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  50.66 
 
 
404 aa  362  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  51.32 
 
 
403 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  52.3 
 
 
406 aa  358  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  51.08 
 
 
403 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  50.13 
 
 
404 aa  349  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  51.35 
 
 
403 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  49.6 
 
 
411 aa  348  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  49.87 
 
 
403 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  50.81 
 
 
403 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  50.4 
 
 
411 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  50.94 
 
 
403 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  50.4 
 
 
403 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  49.6 
 
 
403 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  48.08 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  50.4 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  49.59 
 
 
414 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  45.61 
 
 
423 aa  325  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  50.13 
 
 
403 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  50.4 
 
 
403 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  45.88 
 
 
416 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  43.86 
 
 
403 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  47.01 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  45.65 
 
 
418 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  45.88 
 
 
439 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  44.13 
 
 
418 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 
419 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  45.95 
 
 
412 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
421 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  44.5 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  41.73 
 
 
433 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
421 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  36.22 
 
 
455 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 
455 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  36.64 
 
 
467 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  36.64 
 
 
467 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  36.64 
 
 
467 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  36.64 
 
 
467 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  33.33 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  34.19 
 
 
389 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  33.33 
 
 
389 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  33.05 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  33.33 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
395 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  31.36 
 
 
425 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.39 
 
 
435 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  36.32 
 
 
606 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
435 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  31.15 
 
 
440 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  36.79 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  36.79 
 
 
1046 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  31.23 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.23 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  30.85 
 
 
417 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  36.56 
 
 
468 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  30.29 
 
 
436 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  31.37 
 
 
428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  32.55 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  33.49 
 
 
418 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
420 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
438 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
438 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  34.46 
 
 
409 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  30.13 
 
 
420 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.23 
 
 
426 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.23 
 
 
426 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.23 
 
 
426 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.23 
 
 
426 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  32.88 
 
 
389 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  32.88 
 
 
389 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  28.69 
 
 
418 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  31.13 
 
 
409 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  38.02 
 
 
394 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  31.61 
 
 
422 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  32.2 
 
 
895 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  30.75 
 
 
912 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  37.94 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
398 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  30.73 
 
 
387 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  32.64 
 
 
437 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  33.96 
 
 
427 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.54 
 
 
441 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
403 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
397 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
444 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  29.25 
 
 
905 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.91 
 
 
422 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 
398 aa  159  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.62 
 
 
402 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 
428 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  37.4 
 
 
421 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>