More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2211 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  98.24 
 
 		 455 aa  872    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  100 
 
 		 455 aa  883    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  75.34 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  75.34 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  75.34 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  75.34 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  74.77 
 
 		 465 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  75.79 
 
 		 1046 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  76.02 
 
 		 606 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  75.57 
 
 		 468 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  75.79 
 
 		 468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  37.35 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  36.82 
 
 		 404 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 406 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  35.93 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  33.93 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  35.52 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  34 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  34.45 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  34.9 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  32.69 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  36.18 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  36.18 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  34.79 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  35.17 
 
 		 403 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 417 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  32.51 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  26.65 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  26.65 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  26.65 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  26.65 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  26.65 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  26.65 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  26.65 
 
 		 389 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  26.65 
 
 		 389 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.38 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  37.77 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  37.23 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 411 aa  140  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 382 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  30.2 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  38.3 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  27.65 
 
 		 895 aa  133  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  25.95 
 
 		 912 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  27.54 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 402 aa  126  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 406 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.79 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  28.15 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  27 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.42 
 
 		 428 aa  124  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.68 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.54 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.68 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  25.41 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  26.33 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  29.86 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  24.88 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  29.62 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  29.62 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>