More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2459 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  766    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  766    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  80.89 
 
 
387 aa  620  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  54.93 
 
 
389 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  54.93 
 
 
389 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  54.93 
 
 
389 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  55.2 
 
 
389 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  55.2 
 
 
389 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  54.67 
 
 
389 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  54.93 
 
 
389 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  54.93 
 
 
389 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  54.67 
 
 
389 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  54.67 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  50.58 
 
 
382 aa  359  4e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
395 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  37.31 
 
 
394 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  30.42 
 
 
895 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  31.08 
 
 
912 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  30.59 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  28.74 
 
 
441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  30.1 
 
 
402 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
417 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  32.53 
 
 
405 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  29.56 
 
 
905 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  32.27 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  30.2 
 
 
426 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  30.2 
 
 
426 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
398 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  31.43 
 
 
406 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  31.43 
 
 
406 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  30.2 
 
 
426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  31.43 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
397 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  30.37 
 
 
395 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  30.67 
 
 
420 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  35.62 
 
 
398 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.76 
 
 
403 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
403 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  32.56 
 
 
406 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  29.18 
 
 
418 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 
435 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  25.89 
 
 
425 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.64 
 
 
426 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  28.12 
 
 
403 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  31.58 
 
 
417 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
435 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  31.02 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
438 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  31.01 
 
 
399 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
438 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  30.5 
 
 
440 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  26.93 
 
 
403 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  31.05 
 
 
390 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 
428 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  30.2 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  30.2 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  30.2 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  30.2 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  30.2 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
404 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
443 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  27.14 
 
 
431 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  29.57 
 
 
414 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  29.71 
 
 
404 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  29.87 
 
 
422 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  31.14 
 
 
418 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.88 
 
 
431 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  25.97 
 
 
424 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.61 
 
 
404 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.73 
 
 
403 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  33.43 
 
 
414 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  28.99 
 
 
453 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  27.76 
 
 
423 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  24.74 
 
 
424 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  30.1 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  31.66 
 
 
917 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.84 
 
 
416 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  27.3 
 
 
437 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
406 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  26.79 
 
 
403 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  28.77 
 
 
472 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
413 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  29.7 
 
 
439 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  29.67 
 
 
893 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  28.1 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  29.3 
 
 
459 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
422 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  29.71 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  27.4 
 
 
403 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  24.57 
 
 
431 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  27.89 
 
 
403 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 
452 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>