More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3142 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  767    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  59.71 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  55.17 
 
 		 405 aa  349  6e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  48.51 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  59.61 
 
 		 412 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  49.49 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  50.64 
 
 		 395 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  55.05 
 
 		 399 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2807  major facilitator superfamily MFS_1  62.77 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.297836  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  39.63 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  40.16 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  39.89 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  39.89 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  39.89 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  39.89 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  39.89 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  39.89 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 395 aa  243  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  35.4 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  31.25 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  34.15 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.15 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  32.35 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  33.91 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  32.14 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  32.17 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  32.15 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  34.88 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  32.53 
 
 		 905 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  34.15 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.15 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.15 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.15 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  34.15 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  31.44 
 
 		 912 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  31.87 
 
 		 895 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  33.87 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 425 aa  162  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 422 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  32.71 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  32.91 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  33.08 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  32 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  33.92 
 
 		 403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  32.27 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  32.82 
 
 		 403 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  36.52 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  30.82 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  34.7 
 
 		 917 aa  150  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  31.74 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  34.81 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 414 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  34.46 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  36.67 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  36.67 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>