More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3401 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  99.15 
 
 
467 aa  786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  99.15 
 
 
467 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  99.79 
 
 
1046 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  99.15 
 
 
467 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  97.22 
 
 
606 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  99.15 
 
 
467 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  99.57 
 
 
468 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  100 
 
 
468 aa  894    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  76.3 
 
 
455 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  75.62 
 
 
455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  73.13 
 
 
465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  37.95 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  38.77 
 
 
404 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  37 
 
 
404 aa  253  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  38.36 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  36.5 
 
 
403 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 
404 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  37.93 
 
 
406 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  36.68 
 
 
423 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  33.97 
 
 
418 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  35.19 
 
 
418 aa  229  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  34.51 
 
 
403 aa  226  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  34.3 
 
 
403 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  35 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  35.65 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  35.31 
 
 
411 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  33.05 
 
 
418 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  36.53 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  36.83 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
421 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  34.26 
 
 
403 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
419 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  33.4 
 
 
439 aa  209  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
419 aa  209  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  34.82 
 
 
403 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  34.48 
 
 
403 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  35.68 
 
 
403 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  34.71 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  35.68 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  33.26 
 
 
433 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  34.55 
 
 
412 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.64 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  27.64 
 
 
389 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
421 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  26.99 
 
 
389 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.76 
 
 
389 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.76 
 
 
389 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  31.22 
 
 
395 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
397 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
397 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
395 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
382 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  37.81 
 
 
403 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
403 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.54 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  35.56 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  29.7 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  29.47 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  29.47 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  29.85 
 
 
418 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  33.03 
 
 
394 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.11 
 
 
421 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.11 
 
 
421 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  28 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  28.3 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
420 aa  120  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  26.23 
 
 
425 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  27.01 
 
 
895 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.5 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
398 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  28.3 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25.63 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25.63 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.14 
 
 
912 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  32.28 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  25.4 
 
 
426 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  28.42 
 
 
484 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.41 
 
 
422 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.24 
 
 
417 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  26.47 
 
 
917 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  28.31 
 
 
456 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
438 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 
438 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  27.95 
 
 
455 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  29.74 
 
 
401 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  27.32 
 
 
418 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>