More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5214 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  783    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  74.05 
 
 		 398 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  71.47 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  60.95 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  60.95 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  57.47 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  57.47 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  56.82 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  54.67 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  55.17 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  55.06 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  47.3 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2807  major facilitator superfamily MFS_1  50.92 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.297836  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  35 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  34.11 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  34.46 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  34.2 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  34.2 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  34.2 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  34.2 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  34.2 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  33.94 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  35.31 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  35.31 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  35.31 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  34.68 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  35.22 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  34.72 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  33.68 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  32.67 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  32.56 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  32.28 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  33.83 
 
 		 895 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  32.73 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  35.08 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  34.2 
 
 		 912 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  34.58 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  35.56 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  35.77 
 
 		 905 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  35.56 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  35.56 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  35.56 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  35.56 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 438 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 438 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  34.97 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  34.97 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.91 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  34.19 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  34.19 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  32.26 
 
 		 417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  33.58 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  35.25 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  36.94 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  34.86 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  34.04 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  32.91 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  32.01 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  33.66 
 
 		 917 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 418 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>