More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03875 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  100 
 
 		 431 aa  874    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  60.62 
 
 		 424 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  59.48 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  50.61 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  50.86 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  39.23 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 417 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 440 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.76 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  38.76 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  39.02 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  38.76 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  36.36 
 
 		 912 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  36.69 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  39.67 
 
 		 905 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.76 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.76 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.76 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  38.76 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  37.78 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  37.53 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  38.97 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  35.63 
 
 		 895 aa  292  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  37.91 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 426 aa  286  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 439 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  37.65 
 
 		 452 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 429 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  37.07 
 
 		 917 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  37.59 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  37.99 
 
 		 893 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  37.34 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  37.34 
 
 		 424 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 460 aa  256  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 422 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 459 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 424 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 506 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  29.66 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  26.37 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  26.77 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  26.37 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  26.37 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  26.37 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  26.37 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  26.37 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  26.37 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  26.87 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  28.28 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 418 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 394 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  27.12 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.33 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.02 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  27.15 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 439 aa  140  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  27.32 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 421 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>