More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4629 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  100 
 
 		 494 aa  989    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  58.37 
 
 		 506 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  43.95 
 
 		 893 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  34.16 
 
 		 895 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 		 428 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  39.37 
 
 		 452 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  39.68 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  37.88 
 
 		 912 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  39.68 
 
 		 431 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  40.2 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  41.29 
 
 		 905 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 453 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  38.8 
 
 		 917 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  36.21 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  36.21 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  40.63 
 
 		 460 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.55 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  35.88 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  36.54 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  35.39 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 438 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  36.54 
 
 		 426 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  36.54 
 
 		 426 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  36.54 
 
 		 426 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  36.54 
 
 		 426 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  38.31 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  37.04 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  37.67 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  37.87 
 
 		 424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 424 aa  183  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  37.33 
 
 		 424 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  37.09 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  34.31 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 406 aa  136  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 397 aa  133  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 400 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 398 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3444  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 398 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.51 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.51 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.51 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.51 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.51 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.51 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.51 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.51 
 
 		 389 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  30.96 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  27.14 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 439 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 395 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 419 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1543  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 206 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 394 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1444  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 416 aa  113  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  30.94 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>