44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1225 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 436 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  28.43 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  30.62 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  27.82 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.54 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  21.54 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.69 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  21.62 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  21.62 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  21.62 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  21.62 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.73 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  19.95 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  26.77 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  20 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  24.36 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>