70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7065 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  837    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 418 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 417 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6021  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8436  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.599978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  36.24 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0959  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  28.25 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1069  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  29.55 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  27.62 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1642  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2901  hypothetical protein  34.72 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.2 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.67 
 
 		 423 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.75 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  27.89 
 
 		 189 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.14 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.15 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.06 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.58 
 
 		 423 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.41 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1731  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  21.54 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  30.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  26.27 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  30.77 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  30.77 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>