104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1731 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0165  hypothetical protein  59.77 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0200  hypothetical protein  60.92 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0224  hypothetical protein  60.34 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0181  hypothetical protein  60.92 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0171  membrane transport protein; multidrug resistance protein  60.34 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0179  hypothetical protein  60.92 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0204  hypothetical protein  60.34 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5121  hypothetical protein  59.77 
 
 		 177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.771196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0200  hypothetical protein  60.34 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0168  membrane transport protein; multidrug resistance protein  59.77 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.450753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 381 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 381 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 411 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 420 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  27.65 
 
 		 381 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 399 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  28.57 
 
 		 381 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 381 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 431 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 384 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  26.14 
 
 		 381 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 397 aa  52  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 397 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 403 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  35.56 
 
 		 403 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 403 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 403 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  32.73 
 
 		 487 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 423 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 381 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 381 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 418 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.52 
 
 		 416 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  36.08 
 
 		 404 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  32.97 
 
 		 406 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 466 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  34.57 
 
 		 415 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 406 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  35.05 
 
 		 404 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 387 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 416 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  26.57 
 
 		 403 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 411 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  40 
 
 		 404 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  40 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  40 
 
 		 404 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  40 
 
 		 404 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  40 
 
 		 404 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  35.05 
 
 		 409 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  27.55 
 
 		 401 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 421 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 421 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 402 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 393 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 404 aa  44.3  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 413 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 433 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 413 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  35 
 
 		 408 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 408 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  30.61 
 
 		 411 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  34.88 
 
 		 401 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  35 
 
 		 409 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  35 
 
 		 408 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 422 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  35 
 
 		 408 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  35 
 
 		 408 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 415 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  35 
 
 		 408 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 466 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 413 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 396 aa  42  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 426 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  28.67 
 
 		 390 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  27.91 
 
 		 398 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 412 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  25.83 
 
 		 435 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 438 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 438 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 537 aa  41.6  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  28.42 
 
 		 424 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1859  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 421 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  normal  0.419035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>