268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3238 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  803    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  94.9 
 
 
419 aa  697    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  93.66 
 
 
411 aa  733    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  62.56 
 
 
425 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  62.56 
 
 
425 aa  478  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  46.23 
 
 
435 aa  346  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 
439 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 
405 aa  315  7e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  42.86 
 
 
419 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
437 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
437 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  45.19 
 
 
418 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  46.54 
 
 
426 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
413 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
413 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
413 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
413 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
413 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  43.75 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  44.75 
 
 
425 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  44.53 
 
 
413 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  43.6 
 
 
419 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  43.34 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  43.34 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  46.13 
 
 
424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
431 aa  280  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
429 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  40.64 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  39.95 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 
420 aa  265  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
411 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 
429 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
366 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  26.22 
 
 
615 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  35.85 
 
 
522 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  41.35 
 
 
544 aa  82.8  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.72 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.75 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
397 aa  63.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3232  hypothetical protein  78.38 
 
 
105 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  24.08 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.62 
 
 
399 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 
419 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.89 
 
 
421 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  24.63 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  24.63 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  25.27 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.61 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 
521 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  24.54 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  24.54 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  24.54 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 
525 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.21 
 
 
409 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  25.44 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  24.18 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 
540 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
411 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
396 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
613 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
404 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
522 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  30.77 
 
 
398 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  27.46 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  26.79 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  25.36 
 
 
403 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.55 
 
 
399 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  27.11 
 
 
410 aa  50.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.01 
 
 
399 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  24.18 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
516 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.46 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.5 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.55 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.46 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.24 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  32.9 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.01 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  24.71 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.15 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.52 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  24.68 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>