207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0531 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
388 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2209  major facilitator superfamily transporter  55.71 
 
 
393 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  50.27 
 
 
392 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  48.24 
 
 
392 aa  322  8e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  49.73 
 
 
392 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3462  hypothetical protein  47.03 
 
 
392 aa  298  9e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2478  hypothetical protein  47.29 
 
 
392 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  46.77 
 
 
392 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1334  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 
392 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  46.77 
 
 
392 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1330  hypothetical protein  46.77 
 
 
392 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2473  hypothetical protein  46.77 
 
 
392 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  46.77 
 
 
392 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0089  hypothetical protein  47.01 
 
 
410 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  43.96 
 
 
388 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1718  major facilitator superfamily transporter  36.39 
 
 
410 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 
410 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  40.75 
 
 
408 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  40.27 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  37.19 
 
 
398 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2019  major facilitator superfamily transporter  38.42 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38730  major facilitator superfamily transporter  38.5 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  38.44 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3781  major facilitator superfamily transporter  39.9 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4492  major facilitator superfamily transporter  40.27 
 
 
400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144126  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1407  major facilitator superfamily transporter  38.15 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  35.96 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1420  major facilitator superfamily transporter  40.54 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909513  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2043  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3578  major facilitator superfamily transporter  36.8 
 
 
399 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0428659  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3216  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0335223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0869  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0235133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2703  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3162  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3201  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1907  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3302  major facilitator superfamily transporter  38.57 
 
 
402 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  37.57 
 
 
403 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3880  major facilitator superfamily transporter  35.26 
 
 
409 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3711  major facilitator transporter  36.97 
 
 
411 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3885  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 
402 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0727  major facilitator superfamily transporter  36.42 
 
 
404 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0710  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
404 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0803  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
404 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0347  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
404 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0831  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
404 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3850  major facilitator superfamily transporter  34.33 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4072  major facilitator superfamily transporter  35.78 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0084  major facilitator superfamily transporter  34.75 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  35.26 
 
 
410 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3923  major facilitator superfamily transporter  35.55 
 
 
404 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  34.75 
 
 
399 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3783  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 
405 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3893  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 
405 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3953  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 
405 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.515945  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 
407 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28990  Major facilitator superfamily transporter, MFS_1  33.96 
 
 
409 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03322  predicted transporter  32.8 
 
 
405 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03275  hypothetical protein  32.8 
 
 
405 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3672  major facilitator superfamily transporter  32.8 
 
 
419 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0242  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
416 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1495  major facilitator superfamily transporter  36.73 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.490608  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3955  major facilitator superfamily transporter  32.8 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0243  major facilitator superfamily transporter  32.8 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4793  major facilitator superfamily transporter  32.8 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2553  major facilitator superfamily transporter  35.28 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3849  major facilitator superfamily transporter  32.53 
 
 
419 aa  173  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3757  major facilitator superfamily transporter  32.97 
 
 
416 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2837  major facilitator superfamily transporter  35.29 
 
 
397 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2423  major facilitator superfamily transporter  36.13 
 
 
403 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2608  major facilitator superfamily transporter  33.82 
 
 
395 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.183302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2756  major facilitator superfamily transporter  33.89 
 
 
397 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2751  major facilitator superfamily transporter  34.48 
 
 
397 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2935  major facilitator superfamily transporter  33.89 
 
 
397 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3773  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 
405 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.955026  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1513  major facilitator transporter  33.7 
 
 
390 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  31.49 
 
 
388 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
413 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4799  major facilitator transporter  43.04 
 
 
182 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162321  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4796  major facilitator transporter  35.64 
 
 
225 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6224  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.806406  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.05 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.77 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  21.26 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  21.78 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.62 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  21.78 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.26 
 
 
381 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.68 
 
 
400 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.68 
 
 
400 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  21.52 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25.58 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  22.37 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>