258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1171 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
424 aa  797    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 
420 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
424 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  42.03 
 
 
425 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  38.83 
 
 
413 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  38.83 
 
 
413 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  38.83 
 
 
413 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  38.83 
 
 
413 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  38.83 
 
 
408 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  41.65 
 
 
429 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  38.82 
 
 
413 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
429 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  40.53 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  43.34 
 
 
425 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  40.29 
 
 
419 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  40.29 
 
 
419 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 
425 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  38.27 
 
 
413 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 
439 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  38.06 
 
 
435 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  38.97 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 
411 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  37.1 
 
 
405 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
431 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  40.69 
 
 
411 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
429 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  37.78 
 
 
419 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  40.78 
 
 
412 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  38.32 
 
 
426 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  40.52 
 
 
419 aa  210  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
405 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
366 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  28.64 
 
 
615 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  32.74 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.7 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  34.03 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  29.1 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.42 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  31.65 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.24 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  22.97 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
385 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  29.71 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  32.68 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1879  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.269185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  32.06 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
457 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 
504 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 
458 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
506 aa  53.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  34.9 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  29.03 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  25.5 
 
 
393 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.31 
 
 
487 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  25.5 
 
 
393 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.65 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  30.2 
 
 
464 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
403 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  26.97 
 
 
467 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.86 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  24.87 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  28.05 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  25.33 
 
 
433 aa  51.2  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  30.13 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  30.13 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  23.5 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  29.53 
 
 
464 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  30.13 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  30.13 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  30.13 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  25.13 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
464 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  25.52 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  29.79 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  29.49 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  29.79 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  29.79 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  25.52 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  30.09 
 
 
407 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  29.53 
 
 
464 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  25.52 
 
 
393 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>