190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3259 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  93.66 
 
 		 412 aa  682    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  809    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  94.16 
 
 		 419 aa  692    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  62.84 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  62.84 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  47.45 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  44.83 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  44.75 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 424 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  43.64 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  44 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  42.82 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 429 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 420 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 411 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 615 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  35.22 
 
 		 522 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  42.31 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.37 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3232  hypothetical protein  83.78 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 395 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 540 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.77 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 613 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 		 521 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3498  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  23.55 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.72 
 
 		 534 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  23.67 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.28 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 474 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 474 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 474 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 		 494 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 530 aa  46.6  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 522 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  30.89 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  29.67 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>