209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0758 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  76.18 
 
 
435 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
439 aa  872    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  67.45 
 
 
426 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  50.59 
 
 
419 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
405 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  46.7 
 
 
425 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 
425 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 
429 aa  329  7e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  46.36 
 
 
411 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 
424 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  46.48 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  45.73 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  41.73 
 
 
418 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  41.46 
 
 
429 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  42.79 
 
 
425 aa  299  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  41.67 
 
 
413 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
411 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
420 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  39.76 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  39.76 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  39.76 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  39.76 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  39.76 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  39.76 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  40.46 
 
 
419 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  40.21 
 
 
419 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  40.21 
 
 
419 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  40.1 
 
 
405 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
429 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 
424 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
366 aa  171  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  34.02 
 
 
522 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  24.58 
 
 
544 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  25.25 
 
 
615 aa  90.1  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.22 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.56 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  21.86 
 
 
411 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
391 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
391 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  23.47 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.36 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.36 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.36 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.36 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.42 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.36 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.36 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.36 
 
 
399 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.11 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
438 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  22.11 
 
 
399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.11 
 
 
399 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.7 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.27 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.1 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  23.63 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  23.32 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  23.37 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.54 
 
 
400 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  27.41 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.04 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.47 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 
538 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.08 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.33 
 
 
505 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  34.69 
 
 
384 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  33.67 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
429 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.17 
 
 
410 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.92 
 
 
417 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.49 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.12 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  25.31 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  33.67 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  27.16 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  33.67 
 
 
381 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.01 
 
 
400 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.76 
 
 
416 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.36 
 
 
395 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.89 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  23 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  32.65 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  30.91 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.71 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  32.65 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  22.22 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>