209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3519 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  83.25 
 
 		 426 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  67.52 
 
 		 439 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  66.04 
 
 		 435 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  46.3 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 412 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 419 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 420 aa  272  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 419 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  38.12 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  40 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  37.84 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  37.09 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  33.33 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 615 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  25.71 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.88 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.25 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 555 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.75 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.49 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.41 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.64 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  23.41 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.27 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 442 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.08 
 
 		 538 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  23.29 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 386 aa  53.5  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.23 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  21.57 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  21.43 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.22 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  21.57 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  29.09 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 384 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  30.36 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4710  major facilitator superfamily transporter  28.85 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  21.96 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  25.97 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  21.96 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  30.36 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  30.39 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  20.18 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.31 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  28.18 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  21.96 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  19.83 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  26.21 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>