260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0094 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  827    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  57.36 
 
 
405 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  50.6 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  51.23 
 
 
435 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 
437 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 
437 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  50.73 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  41.99 
 
 
411 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  44.05 
 
 
425 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 
425 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  42.86 
 
 
412 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  41.71 
 
 
419 aa  299  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
429 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  43.41 
 
 
405 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  40.25 
 
 
418 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
411 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 
420 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  40.9 
 
 
413 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  40.05 
 
 
429 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 
424 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  40.9 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
413 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
413 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
413 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
413 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  40 
 
 
408 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  39.39 
 
 
413 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  40.43 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  40.16 
 
 
419 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  40.16 
 
 
419 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
429 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
424 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
366 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  28.79 
 
 
615 aa  111  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  24.14 
 
 
544 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  33.13 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.49 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  30.71 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.54 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  33.94 
 
 
452 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  36.36 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  33.03 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.11 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  23.14 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  27.27 
 
 
452 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  33.03 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.11 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  33.03 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  27.41 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  33.03 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
402 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
448 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.95 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.33 
 
 
407 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  26.59 
 
 
399 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  23.48 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  23.48 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  24.44 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  27.17 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  23.56 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.59 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  23.24 
 
 
402 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.59 
 
 
396 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  23.04 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  26.01 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  27.01 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  27.01 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  23.04 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.56 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  26.01 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  24.46 
 
 
444 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  23.04 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
409 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.56 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.94 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  32.14 
 
 
456 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
444 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.06 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.06 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
452 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.06 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.06 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.69 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  23.48 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.06 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.07 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.69 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  24.19 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  27.69 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  27.69 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  23.19 
 
 
402 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>