More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3285 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  785    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  61.39 
 
 
418 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  60.57 
 
 
408 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  60.57 
 
 
413 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  60.57 
 
 
413 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  60.57 
 
 
413 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  60.57 
 
 
413 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  60.57 
 
 
413 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  56.25 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  59.95 
 
 
413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  56.46 
 
 
420 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  55.04 
 
 
425 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  52.28 
 
 
429 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  52.27 
 
 
419 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  52.27 
 
 
419 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  52.53 
 
 
419 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 
429 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  52.11 
 
 
411 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
405 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 
431 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  43.41 
 
 
419 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  40.84 
 
 
435 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  40.64 
 
 
425 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  40.64 
 
 
425 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
439 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  41.49 
 
 
411 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  41.15 
 
 
419 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  40.05 
 
 
412 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
437 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
437 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  39.31 
 
 
426 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
424 aa  217  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
366 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  26.49 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  45.83 
 
 
522 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  27.6 
 
 
615 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.83 
 
 
387 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.24 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.49 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.47 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  29.75 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  28.73 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.51 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  35.16 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.2 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  21.66 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.56 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  28.4 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.43 
 
 
685 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.33 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
409 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.55 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.64 
 
 
395 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
417 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.48 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.21 
 
 
429 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.28 
 
 
421 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.81 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  30.38 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  25 
 
 
420 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  30.3 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  23.44 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  28.31 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  23.18 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  23.18 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  23.18 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.8 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.78 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.55 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.24 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.55 
 
 
383 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  35.51 
 
 
484 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.53 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
449 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  34.35 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.68 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  32.17 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
449 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
516 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  30.34 
 
 
395 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  26.96 
 
 
531 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.79 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>