280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2341 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  823    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  40.77 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 420 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  34.33 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 410 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  28.36 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 406 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  26.4 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.04 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  28.5 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  29.04 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  28.93 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  28.79 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 398 aa  126  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.37 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  28.93 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  27.39 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  26.65 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  26.18 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 402 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  26.65 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  28.07 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  28.07 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.07 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.07 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.07 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.07 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  27.89 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  27.89 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  27.89 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.89 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  27.89 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  26.53 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  25.56 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  26.82 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  27.46 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>