202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2792 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
366 aa  711    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  34.59 
 
 
425 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
425 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  32.35 
 
 
411 aa  186  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  32.08 
 
 
419 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  31.81 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
429 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  31.17 
 
 
435 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
437 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
437 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  33.7 
 
 
426 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
439 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  31.08 
 
 
429 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
411 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
424 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  33.06 
 
 
419 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  32.63 
 
 
405 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
424 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
408 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
413 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
413 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
413 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
413 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
420 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  30.51 
 
 
418 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  29.81 
 
 
419 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  26.84 
 
 
425 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  29.54 
 
 
413 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  29.54 
 
 
419 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  29.54 
 
 
419 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
429 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  35.09 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  25 
 
 
615 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2614  hypothetical protein  23.88 
 
 
392 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  23.38 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2561  hypothetical protein  23.43 
 
 
392 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2514  hypothetical protein  23.43 
 
 
392 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  26.88 
 
 
522 aa  63.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2602  hypothetical protein  23.43 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.92 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  28.47 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.35 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  30.77 
 
 
398 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 
495 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  26.75 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 
495 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  27.05 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  30.46 
 
 
398 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.93 
 
 
384 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  32.09 
 
 
409 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
430 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  28.89 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  28.89 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.5 
 
 
498 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.6 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  24.22 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  28.89 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 
476 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  29.27 
 
 
487 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 
478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.5 
 
 
504 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 
478 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.85 
 
 
478 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.36 
 
 
478 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  23.13 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 
478 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.36 
 
 
479 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.36 
 
 
469 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 
480 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.36 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.18 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  24.73 
 
 
464 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
455 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
408 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  22.46 
 
 
395 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2699  hypothetical protein  20.76 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  25.27 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  32.5 
 
 
429 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
395 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  24.73 
 
 
464 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02247  predicted transporter  21.01 
 
 
392 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.94 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  24.4 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02207  hypothetical protein  21.01 
 
 
392 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  25 
 
 
386 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>