More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4098 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  99.76 
 
 
419 aa  819    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
419 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  69.47 
 
 
425 aa  554  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  63.05 
 
 
429 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  66.5 
 
 
429 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 
424 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  54.81 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  54.34 
 
 
413 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  54.34 
 
 
408 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  54.34 
 
 
413 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  54.34 
 
 
413 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  56.9 
 
 
420 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  54.34 
 
 
413 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  54.34 
 
 
413 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  54.73 
 
 
413 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  51.28 
 
 
405 aa  395  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  48.52 
 
 
411 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
429 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  40.57 
 
 
435 aa  292  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
431 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  41.3 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  42.04 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
405 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
437 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
437 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  42.18 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  42.43 
 
 
419 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  40.5 
 
 
419 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  39.47 
 
 
426 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
424 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
366 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  29.97 
 
 
387 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  27.67 
 
 
615 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  35.08 
 
 
522 aa  113  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  31.82 
 
 
544 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.04 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  25.8 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
406 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  25.32 
 
 
685 aa  63.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.23 
 
 
440 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.33 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  29.7 
 
 
462 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
408 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.67 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.39 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.27 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  25.96 
 
 
405 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.82 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  29.89 
 
 
429 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
516 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  24.86 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  21.56 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.92 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.28 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
454 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.17 
 
 
453 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  28.46 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  27.01 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  25.95 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  26.92 
 
 
401 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  28.19 
 
 
539 aa  53.1  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  22.03 
 
 
411 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  25.3 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  20.67 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  26.24 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  24.42 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  30.41 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
462 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  21.11 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 
396 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  30.89 
 
 
461 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
510 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  29.91 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.7 
 
 
424 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  29.73 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>