More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44665 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  100 
 
 
522 aa  1069    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  40 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  45.83 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  38.66 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  40.96 
 
 
429 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
420 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 
424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  35.08 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  35.08 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  35.08 
 
 
419 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  42.5 
 
 
425 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
405 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
437 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
437 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
431 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  32.09 
 
 
425 aa  102  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
425 aa  102  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
439 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  36.25 
 
 
419 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  39.01 
 
 
435 aa  100  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  35.22 
 
 
412 aa  100  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 
429 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  37.09 
 
 
411 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  37.75 
 
 
426 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  33.13 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  28.06 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  29 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.94 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
366 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.94 
 
 
381 aa  60.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
403 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.94 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.47 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.47 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.41 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
503 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.35 
 
 
590 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 
512 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 
534 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
387 aa  57  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  24.63 
 
 
452 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.69 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
516 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23 
 
 
381 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
408 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  26.82 
 
 
420 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
545 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
565 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
517 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
401 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 
478 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.97 
 
 
381 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  31.9 
 
 
398 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 
520 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  27.44 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  24.57 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.4 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  29.51 
 
 
405 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 
534 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
490 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 
540 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 
518 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.48 
 
 
517 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1778  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  26.62 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  26.9 
 
 
575 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  26.5 
 
 
490 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 
493 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1882  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
393 aa  50.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.36796  normal  0.170219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 
520 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.16 
 
 
395 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  28.57 
 
 
469 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
460 aa  50.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  28.07 
 
 
573 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  27.33 
 
 
429 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
476 aa  50.4  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  27.21 
 
 
466 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  28.12 
 
 
462 aa  50.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  26.74 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.04 
 
 
505 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 
458 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
398 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  28.67 
 
 
579 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  29.1 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
399 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  27.65 
 
 
478 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>