More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2268 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 425 aa  833    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  833    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  62.84 
 
 		 411 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  61.59 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  61.84 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  51.54 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 		 405 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  46.14 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 413 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 420 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  41.45 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  43.61 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  41.45 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  41.45 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  41.45 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  41.85 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  42.01 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 		 431 aa  279  8e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  42.27 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 429 aa  259  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 366 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 615 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  32.09 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  37.5 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.09 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.22 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  23.3 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  25.28 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  33.95 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 516 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.98 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.65 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.65 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.63 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 504 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 399 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  23.97 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.73 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.91 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 432 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.91 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  32.1 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  32.1 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  32.1 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4096  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>