More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4594 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  93.05 
 
 		 447 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  98.66 
 
 		 447 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  54.92 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  55.48 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  52.76 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  51.56 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  53.38 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  51.12 
 
 		 444 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 450 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  49.26 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  42.12 
 
 		 445 aa  312  5.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 432 aa  269  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  36.85 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  42.49 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.18 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.61 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.3 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.75 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  29.77 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  32.45 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  34.46 
 
 		 406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  33.9 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.99 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  30.18 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 446 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 485 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 454 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  29.95 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 457 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  30.02 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  31.22 
 
 		 452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 439 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 449 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  29.06 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  29.4 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  31.77 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  30.56 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.79 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.79 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.79 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.79 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.79 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.79 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  30.07 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  31.12 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 465 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.79 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  30.11 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  29.4 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  29.37 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  29.65 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>