More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5692 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  68.52 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  59.13 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  59.45 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  55.58 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  55.58 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  54.87 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  58.76 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  58.98 
 
 		 487 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  54.77 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  58.74 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  54.68 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  42.23 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  37.83 
 
 		 406 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.85 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 453 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  32.41 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  35.42 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 439 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.49 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  37 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 452 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  37 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  35.76 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 410 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  34.34 
 
 		 455 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 457 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.81 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 438 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  33.56 
 
 		 451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  33.56 
 
 		 451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  33.56 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.56 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  33.56 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  33.56 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.16 
 
 		 465 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  33.56 
 
 		 451 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  34.46 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.57 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 453 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 446 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2253  general substrate transporter  40.25 
 
 		 409 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 579 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 454 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.25 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  32 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  32.65 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 442 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  34 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.08 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  31.53 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>