More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1254 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
444 aa  870    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  41.22 
 
 
410 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3120  major facilitator transporter  36.74 
 
 
444 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3815  major facilitator transporter  39.29 
 
 
446 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.203479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
445 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  36.89 
 
 
447 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  34.94 
 
 
447 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  35.82 
 
 
447 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3740  major facilitator family transporter  37.41 
 
 
446 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2023  major facilitator transporter  37.59 
 
 
446 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  33.82 
 
 
458 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5626  MFS family transporter  40.69 
 
 
487 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441571  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  34.99 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  36.43 
 
 
441 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.21 
 
 
452 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  35.31 
 
 
438 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.21 
 
 
452 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  36.36 
 
 
453 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  35.68 
 
 
454 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  34.99 
 
 
453 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.23 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  34.44 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7103  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 
458 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2166  major facilitator transporter  37.3 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156507  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.52 
 
 
451 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.13 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.13 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.13 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.13 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
454 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.13 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.13 
 
 
451 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.73 
 
 
454 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  37.21 
 
 
450 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  33.74 
 
 
455 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.98 
 
 
455 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  34.7 
 
 
445 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.91 
 
 
441 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33 
 
 
465 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  32.92 
 
 
432 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.29 
 
 
579 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.01 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03944  MFS transporter  35.28 
 
 
435 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  30.95 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.94 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  32.77 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  35.13 
 
 
453 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.12 
 
 
468 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.28 
 
 
449 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.68 
 
 
461 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64790  putative MFS transporter  39.95 
 
 
444 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518185  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 
451 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  33.89 
 
 
457 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.48 
 
 
475 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  31.97 
 
 
461 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
461 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.06 
 
 
453 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.06 
 
 
453 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
463 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  30.02 
 
 
451 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
447 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  33.64 
 
 
440 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.18 
 
 
445 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  34.66 
 
 
453 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  31.66 
 
 
452 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.44 
 
 
464 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  33.03 
 
 
450 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  30.37 
 
 
449 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 
454 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.45 
 
 
451 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  32.2 
 
 
449 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  32.65 
 
 
530 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  33.41 
 
 
442 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  31.58 
 
 
446 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  33.41 
 
 
442 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  29.95 
 
 
465 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  32.08 
 
 
452 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  32.08 
 
 
452 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  33.18 
 
 
442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  33.93 
 
 
487 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  30.68 
 
 
450 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  30.92 
 
 
450 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  32.21 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  32.63 
 
 
454 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  32.64 
 
 
448 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  34.45 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  30.57 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  33.17 
 
 
445 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  31.93 
 
 
461 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  34.19 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  33.92 
 
 
450 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  34.19 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  30.93 
 
 
455 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
458 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  32.88 
 
 
454 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>